regexp eszközök használata
1. Egyszerűbb feladat:
fasta fejlécből szedjük ki a címzés értékeket sed, awk és grep segítségével. Pl.:
>M01106:57:000000000-A5HD3:1:1101:16625:1543 1:N:0:1| TA-17(142,175)
2. Nehezebb feladat:
Egy fasta adat sorból szedjük ki a fenti két érték előtti és utáni 40 karaktert, pl:
ATTATATACAGACTTAATCTTCAATATATTAACAGATATGCCATTATCCTCTATATAAATCACTTATATTAAATTATATATAATCAATGATCTAGATGCATTCTCTCGCTTCTCTTGATAACAAGCTTCTCTCTGATACCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATTCAAACTTAAACATATCTCTTATATTAAAAATACATATTAAAAGTAATACATGCGTCGCACATAATATAAGCTAGTATATTTTAACTTATAG