A kurzus célja, hogy a hallgatók
◦ alapvető bioinformatikai módszerekben jártasságot szerezzenek.
◦ bioinformatikai problémákat megértsenek és önállóan megoldást találjanak rá
Tanulás eredmények, kompetenciák: a hallgató
Tudás:
- ismeri a fontosabb bioinformatikai fogalmakat és szoftvereket
Képesség:
- képes a bioinformatikai feladatokhoz kapcsolódó biológiai problémát megérteni
- képes az adatait bioinformatikai elemzésekhez előkészíteni, illetve képes mások adatait
értelmezni és kezelni
- képes különféle bioinformatikai szoftverek használatára
- képes bioinformatikai szoftverek problémáit megérteni
Attitűd:
- elkötelezett a minőségi munkavégzés iránt
- törekszik problémamegoldó-képességének fejlesztésére
- nyitott az új bioinformatikai eszközök megismerésére
Autonómia és felelősség:
folyamatosan továbbképzi magát, bővíti ismereteit a bioinformatika területén
A kurzus tartalma, témakörei
Szeminárium:
Zoológiai bioinformatika
Filogenetikai és filogeográfiai bioinformatika,
Genetikai kutatásokhoz, szekvenálásokhoz, evolúciós kutatásokhoz, filogenetikához kapcsolódó
bioinformatika
Gyakorlat:
DNS szekvencia birtokában specifikus primerek tervezése. Homológ szekvenciák keresése
BLAST segítségével az NCBI honlapján, illetve parancssorban. Génszekvenciák megjelenítése,
illesztése, fordítása aminosav szekvenciára. Teljes transzkriptom és genom összeszerelés
lépései. Differenciális génexpresszió analízis módszerei. Genom annotáció.
Értékelés
- A jegy megszerzésének feltétele az órákon való részvétel és a házi feladatok határidőre történő beadása a moodle rendszerben.
- gyakorlati vizsga
- Formator: Dr. Barta Zoltán
- Formator: Nagy Nikoletta Andrea
- Formator: Dr. Sramkó Gábor